Energetisch gezien helpt de langdurige passieve houding van Yin Yoga om het subtiele energiesysteem van het lichaam te verbeteren, waarbij de stroming van onze vitale levenskracht, bekend als prana of chi, wordt verfrist, gestimuleerd en opnieuw in balans gebracht. Chi-energie voedt de belangrijkste organen van het lichaam en hun gerelateerde functies. Een harmonieus evenwicht van chi bevordert een toestand van evenwicht en vrede, en vermindert emotionele reflexmatige reacties om meer ruimte te bieden voor mededogend handelen.
We kunnen emotionele wonden diep in de cellen van het lichaam dragen, en na verloop van tijd kunnen ze zich ophopen. Het vasthouden van "problemen in het weefsel," zo gezegd, kan ons fysiek, emotioneel, energetisch en spiritueel beïnvloeden. Het vasthouden van onopgeloste, pijnlijke emoties zoals woede, wrok, langdurig verdriet, gevoelens van niet goed genoeg zijn, schuld, en vele andere, kan leiden tot algemeen gevoel van ongemak, ongeluk, angst, stress, fysieke pijn, vermoeidheid, en uiteindelijk ziekte. Het diepere fysieke werk van Yin Yoga, gecombineerd met mededogende overpeinzing, kan helpen bij het loslaten van deze verontrustende en verstorende patronen en het bevorderen van vrijheid en welzijn in lichaam, hart en geest.